蛋白质功能预测Venus系列模型面世

本报讯（见习记者江庆龄）3月22日，在上海交通大学举办的蛋白质功能预测Venus（启明星）系列模型发布暨产业合作峰会现场，上海交通大学教授洪亮发布了团队的最新成果，将有助于解决蛋白质设计改造的问题。

洪亮介绍，团队建立的蛋白质序列数据集Venus-Pod含有近90亿条蛋白质序列，包含数亿个功能标签，是全球数据规模最大、功能批注标签最多的数据集。“该数据集作为巨大的‘蛋白质矿藏’，可以从中挖掘出新的蛋白或者生物催化剂，助力生物医药和合成生物学的快速发展。”

同时，洪亮团队瞄准蛋白质“功能预测”这一终极目标，训练了Venus系列模型，其预测蛋白质突变功能的精度位居行业榜首。洪亮表示，Venus系列模型具备“AI定向进化”“AI挖酶”两大核心功能。

值得一提的是，团队配置了配合Venus系列模型的全球首款低通量大体积蛋白质表达、纯化与功能检测自动化一体机，可在24小时内不间断完成100余个蛋白质的表达、纯化与功能检测任务，较人力效率提高近10倍。在软件和硬件的双重加持下，经过Venus系列模型设计的多款蛋白质已经实现了产业化落地。

“我们的宗旨是‘设计AI化，实验自动化’，让科研人员从繁琐的设计和实验中解放出来，只需要提出问题，而由AI和自动化来解决问题，最终将复杂的蛋白质科学发现变成‘傻瓜相机式’的简单过程。”洪亮说。